Todo gateway de pagamento (Mercado Pago, Asaas, PagBank e outros) faz a mesma coisa no fundo: processa Pix, cartão e boleto e coloca o dinheiro na sua conta. A diferença entre eles está em três pontos que vale comparar antes de escolher.
Taxa por transação
Cada gateway cobra uma taxa (percentual + às vezes um valor fixo) por transação aprovada. A taxa do cartão costuma ser mais alta que a do Pix, e pode variar conforme o volume mensal da sua conta — vale simular com o volume real que você espera vender, não com o número mínimo da tabela.
Prazo de recebimento
Existe o recebimento "na hora" (com uma taxa maior) e o recebimento em D+30 ou parcelado conforme a forma de pagamento (com taxa menor). Pra quem depende do caixa girando rápido, esse prazo pesa tanto quanto a taxa em si.
Facilidade de integração
Alguns gateways têm integração pronta com a plataforma de e-commerce (sem precisar de desenvolvedor); outros exigem configuração técnica ou até um programador pra conectar. Isso muda o tempo até a loja conseguir receber o primeiro pagamento.
Não existe "o melhor gateway" de forma absoluta — existe o que melhor equilibra taxa, prazo e facilidade pro momento e volume da sua loja.